Ordre 66 var den mest berygtede kommando, der blev givet i Star wars historie, der signalerer afslutningen på den Galaktiske Republik og begynder det nærmeste sammenbrud af Jedi-ordenen. Mens klontropper blev tvunget til at adlyde ordre 66 på grund af de biochips, der var implanteret i dem i kanon, blev Karen Traviss ' Legender serie Republic Commando maler et langt mørkere portræt af dens udførelse.
Det Republic Commando serie skildrer ordre 66 som en kommando, som alle klontropper blev undervist i stedet for en, de blev tvunget til at adlyde. Ved første øjekast syntes ordren fuldstændig rimelig, da den oprindeligt blev oprettet af Sifo-Dyas som en måde at nedlægge slyngelstater Jedi, der gik imod republikken. Denne ordre var også over ordre 65, som var beregnet til at nedlægge den øverste kansler, hvis et lignende spørgsmål opstod.
I Republic Commando: True Colors, Ordre 66 beskrives som sådan: 'I tilfælde af at Jedi-officerer handler mod republikkens interesser, og efter at have modtaget specifikke ordrer, der er bekræftet, at de kommer direkte fra den øverste kommandør (kansler), vil GAR-ledere fjerne disse officerer med dødelig magt, og kommandoen over GAR vender tilbage til den øverste kommandør (kansler), indtil en ny kommandostruktur er etableret. '
Traviss skildrer den brutale virkelighed i klonekrigene, som skabte en stor spænding imellem Klon troopere og deres Jedi-kommandører. I det væsentlige opdrættet som soldatslaver for republikken svarede livet til en klon-trooper stort set til en droid. Deres fremskyndede aldringsproces sikrede, at klontropper aldrig ville nå et tilfredsstillende liv ud over kamp, selvom kloner var biologisk identiske med mennesker og i stand til biologisk reproduktion. Kloner var også i stand til en bred vifte af menneskelige følelser, hvilket skabte indre uro med hensyn til deres korte eksistens.
Mange klontropper blev også trætte, da krigen trak, da de blev tvunget til at se deres brødre falde i kamp. Republic Commando: Ordre 66 detaljer Delta Squad Commando Scorch's indre frustrationer over dette tab af liv, da han hører navnene på tusinder af faldne klontropper. 'Scorch kunne ikke nu navngive halvdelen af holdene i hans batch på Tipoca træningscenter, endsige mændene i dem. Han skammede sig, som om han havde forrådt dem, 'lyder det i teksten. Efterhånden som krigen trak, begyndte mange klontropper at irritere Jedi for disse tab og endda stille spørgsmålstegn ved deres kompetence.
Jedis holdning til klontropper var ikke bedre, da de blot så dem som engangsbrug. De var især ligeglade med Clone-kommandoer, som de betragtede som statssanktionerede dusørjægere for republikken. På trods af deres ligegyldighed over for disse hold, forstod Jedi deres nødvendighed i krigen. 'Det er problemet med at have intelligente kloner trænet af en ragbag af udisciplinerede bøller - de har i bedste fald vist sig idiosynkratiske, i værste fald ulydige. Men de vinder sandsynligvis krigen for os. Toler dem, 'forklarede Jedi-mester og direktør for specialstyrkenes general Arligan Zey i Republic Commando: Triple Zero .
Som et resultat af denne delte utilfredshed var det ikke svært for mange klontropper at vende deres våben mod deres tidligere kommandører, men der var nogle få bemærkelsesværdige outliers tilbage. Ion Team, som blev ledet af kaptajn Climber, adlød ikke kun ordren, de vendte deres våben mod styrkerne fra kommandør Salvo, der forsøgte at baglæse en gruppe Jedi. Andre kloneskadroner, såsom Omega Squad, Delta Squad og Ordo Skirata, overtrådte også ordren, men falske overholdelse for at undgå mistanke fra imperiet. Mens kloner i disse sidstnævnte eskadriller havde ringe forhold til Jedi, var de langt mere skeptiske over for Palpatine, der afslørede nye Centax-kloner, der ældes normalt.
Mens canon fratager klonerne deres skyld i ordre 66's henrettelse, Legender konfronterer deres forræderi. Denne nuancerede skildring af ordre 66 er mørkere end kanon, men Republic Commando giver dybde til dens henrettelse ved at humanisere sine klonforbrydere og deres lidelse.
