Season of the Chosen indvarslede en helt ny æra med historiefortælling og karakterudvikling, der indtil nu ikke var set i Destiny 2. Guardians dødelige fjende Aldran Sav, nu kendt som Crow, blev omdannet til en værdifuld allieret, der reddede kommandør Zavalas liv i sæsonfinalen. Cabal bragte næsten værgerne til udryddelse under den røde krig, men kejserinde Caiatl viste sig at være anderledes end sine forgængere. Efter mange forsøg på kamp i hendes begrundelse dannede spillerne en urolig alliance med en anden lang tid fjende. Nu Splicer sæson er ankommet, og spillerne vil igen skulle stille spørgsmålstegn ved, hvad de ved om en anden kontradiktorisk gruppe, The Fallen.
Vex har brugt deres simuleringsteknologi til at blokere solen og dække Jordens sidste by i uendeligt mørke. Warlock Vanguard Ikora antyder, at Mithrax måske er den eneste, der har viden til at hacke Vex-netværket og afslutte simuleringen. Mithrax er Kell of House Light, et hus af hans egen skabelse, der er lavet af fritænkende Eliksni, der ønsker at vende tilbage til den store maskines tilstedeværelse. Mithrax er kendt som en hellig splicer; splicers er et lille kollektiv af Eliksni-forskere med avanceret viden inden for cybernetik, bioteknologi og bio-hacking.
Mithrax og splicerne skal lyde velkendt for erfarne værger. Mithrax var den kloge faldne kaptajn, der undgik spillere på Titan. Mithrax er en visionær, der mener, at Eliksni's fremtid ligger med Travellers basking i sit lys, men han rejste sig gennem rækken ligesom enhver anden falden Dreg. Han plejede at være en del af House of Wolves og lovede loyalitet over for Skolas og Mara Sov, efter at hun overtog kommandoen over ulvene ved at besejre Skolas. Efter at Guardians sparede sit liv på Titan, begyndte Mithrax at skabe en troskab med tårnets vogtere. Han vendte tilbage for at hjælpe dem under Zero Hour-missionen og hjalp med at stoppe Eramis fra at stjæle SIVA-teknologi fra en hvælving i det gamle tårn.
Fallen Splicers fra House of Devils brugte SIVA-teknologi til at udfordre Guardians under Rise of Iron udvidelse i Skæbne. Disse cybernetiske faldne ville give os et glimt af de uhyrligheder, vi senere ville møde i Deep Stone Crypt. Disse djævle smeltede sig sammen med SIVA, en nanitteknologi skabt af Warmind Rasputin. Denne nanite-teknologi udryddede engang Iron Lords. Guardians stoppede Djævle fra at forlade Plaguelands med SIVA, men gav spillerne et godt eksempel på, hvad en gruppe faldne splicers er i stand til, når de har stærk teknologi og ressourcer til rådighed.
Mithrax er en af de sidste tilbageværende hellige splicers og har fundet en måde at hacke sig ind i Vex-netværket med en underlig enhed, som han podede på en af sine mekaniske arme. Han har også ændret andre dele af sit væsen, som at installere en slags cybernetisk visir over hans ansigt. Denne Mithrax er langt anderledes end sidste gang, vi stødte på ham, men han har holdt sit ord om at give loyalitet til den rejsende og fortsætter med at være så klog som nogensinde. Denne type manipulation af Vex-teknologi er ny for historien og vil føre spillere til uudforsket område, hvor Vex er berørt.
Vex er blevet antaget at være et resultat af lys og mørke, der spillede et 'blomsterspil' i den oprindelige have længe før universet eksisterede. Vex stammer fra et enkelt tilbagevendende mønster, der dominerede hele simuleringen som en virus, der glædede mørket og irriterede lyset. Vex's modus operandi involverer altid manipulation af tidsstrømmene via simuleringsteknologi, men deres egentlige motiver, bortset fra bare at forsøge at gøre virkeligheden til en omfattende Vex-simulering, er altid blevet omsluttet af mysterium. Nu har Mithrax udviklet en enhed, der lader spillere hacke længere ind i Vex-netværkene end nogensinde før og endelig lære mere om dette mystiske løb med dominerende organiske maskiner.
