Captain America: Civil War afslørede mange mørke hemmeligheder omkring nogle af filmens fremtrædende karakterer. Mens den største afsløring var, at Vintersoldaten (Sebastian Stan) dræbte Tony Starks (Robert Downey Jr.) forældre, var der mange andre åbenbaringer spredt gennem hele filmen. For eksempel viste Peggy Carters (Hayley Atwell) død sine egne afsløringer i både teaterklippet og dets slettede scener.
Under Peggys begravelse afslørede Sharon Carter (Emily VanCamp), at hun var niece af Steve Rogers (Chris Evans) gamle flamme, men dette var ikke den eneste familiehemmelighed, som helten blev gjort opmærksom på. Da han alene tilbragte tid i kirken og behandlede Peggys død, gik Natasha Romanoff (Scarlett Johansson) ind for at sikre, at hendes ven ikke var alene. Mens teatralsk skæringen var en kort samtale, der bundet til, hvem der havde og ikke havde underskrevet Sokovia-aftalerne, indeholdt en slettet scene et større stykke af Black Widows fortid.
På scenen talte Steve om, hvordan han var overrasket over, at Peggy stadig var i live, efter at han kom ud af isen. Natasha mindede ham om, hvor vigtigt det også var for Peggy, at de to kunne genoprette forbindelse, mens der stadig var tid. Nat forklarede også, hvordan hendes beslutning om at forsvinde og finde en ny identitet efter begivenhederne i Captain America: The Winter Soldier bundet til, hvordan Steve havde det.
Efter S.H.I.E.L.D.'s sammenbrud besluttede Natasha at gå og opdage mere om sin familie. Den slettede scene, 'Extended Peggy's Funeral', dykkede mere i sandheden om hendes forældres skæbne. Som hun forklarede, førte Nat's søgning hende til to gravsten ved et kæde-hegn. I en form for lukning trak Nat nogle ukrudt og efterlod blomster på gravstedet. Hun sluttede sin historie med at minde Steve om, at 'vi har, hvad vi har, når vi har det.'
Nat karakter var bygget på tab og udholdenhed. Hun mistede en familie i Vintersoldaten når S.H.I.E.L.D. blev demonteret, men hun støttede sig på Avengers som et andet hjem, som hun kunne sætte krav på. Hun mindede Steve om, at det vigtige var den tid, han havde med de mennesker, han elskede, som Nat aldrig fik med sine forældre. Med Sokovia-aftalerne blev hendes familie truet igen og igen uundgåeligt delt i midten. I sidste ende, hendes død i Avengers: Endgame var noget, der hjalp med at bringe dem sammen igen.
Captain America: Civil War viste, at Black Widows sande troskab lå hos hendes familie. Hendes beslutning om at skifte side i tredje akt tjente som et godt eksempel på det. Imidlertid hjalp den slettede scene, hvor hun diskuterede sine afdøde forældre, med at tilføje endnu et lag til hendes fokus på familie, mens hun også varede for hendes flip senere i filmen. Desværre betragtes Marvel Cinematic Universes slettede scener ikke som kanon, så det er uklart, om disse oplysninger overføres til hovedkontinuiteten.
